سپتوم GC در بالای درگاه تزریق قرار دارد و وظیفه آن ایجاد یک فضای مهر و موم بدون نشتی برای حفظ فشار گاز حامل در داخل سیستم می باشد و جلوگیری از نشد به هنگام انجام سوراخ‌های مکرر توسط سوزن سرنگ که تحمل حرارت های بالا را دارد.